船用充磁变压器与主变压器相位不同步会对船舶电力系统产生多方面的不良影响，具体如下：

增加设备损耗

船用变压器损耗增加：相位不同步会导致变压器内部的磁通分布不均匀，使得铁芯损耗和绕组铜损增加。长期运行下，变压器会出现过热现象，不仅降低了变压器的效率，还会加速绝缘材料的老化，缩短变压器的使用寿命。

电机损耗增加：对于连接在电力系统中的船用电机，相位不同步会使电机定子绕组中的电流出现不平衡，产生额外的铜损和铁损。同时，电机的转矩也会发生波动，导致电机振动加剧，机械损耗增加。这不仅会降低电机的性能，还可能引发电机故障，影响船舶的正常运行。

降低系统稳定性

电压波动：相位不同步会引起系统电压的波动和畸变。当充磁变压器与主变压器相位不一致时，它们输出的电压在幅值和相位上存在差异，叠加后会导致系统电压出现波动，影响船舶上各种电气设备的正常工作。电压波动可能使一些对电压敏感的设备，如电子设备、控制系统等出现误动作或损坏。

频率不稳定：相位不同步可能导致系统频率的不稳定。在船舶电力系统中，频率是一个重要的参数，它直接影响到电机的转速和其他设备的运行性能。相位差异会使系统中的功率分布发生变化，进而影响到系统的频率稳定性。如果频率波动超出了允许范围，会对船舶的电力推进系统、发电机等关键设备造成严重影响，甚至可能导致系统崩溃。

引发保护装置误动作

过流保护误动作：相位不同步会使系统中的电流增大，可能超过过流保护装置的整定值，导致过流保护误动作。一旦过流保护装置误动作，会切断相应的电路，使船舶上的部分设备停电，影响船舶的正常运行。例如，可能导致船舶的照明系统、通风系统等重要设备停止工作，给船舶的安全带来隐患。

差动保护误动作：对于变压器的差动保护，相位不同步会使差动保护回路中的不平衡电流增大。当不平衡电流超过差动保护的整定值时，差动保护会误动作，将变压器切除，导致船舶电力系统的供电中断。这对于船舶的安全航行是非常危险的，尤其是在恶劣海况下，可能会使船舶失去动力，面临更大的风险。